南京农业大学研究生专业目录
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| 70 | 河海大学 | 水利工程、环境科学与工程 |
| 71 | 江南大学 | 轻工技术与工程、食品科学与工程 |
| 72 | 南京林业大学 | 林业工程 |
| 73 | 南京信息工程大学 | 大气科学 |
| 74 | 南京农业大学 | 作物学、农业资源与环境 |
| 75 | 南京中医药大学 | 中药学 |
| 76 | 中国药科大学 | 中药学 |
| 77 | 南京师范大学 | 地理学 |
| 78 | 浙江大学 | 化学、生物学、生态学、机械工程、光学工程、材料科学与工程、电气工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、农业工程、环境科学与工程、软件工程、园艺学、植物保护、基础医学、药学、管理科学与工程、农林经济管理 |
| 79 | 中国美术学院 | 美术学 |
| 80 | 安徽大学 | 材料科学与工程（自定） |
截至2018年3月，学校有32个硕士授权一级学科、15种专业学位授予权、17个博士授权一级学科和15个博士后科研流动站；学校还拥有作物学、农业资源利用、植物保护和兽医学等4个一级学科国家重点学科，蔬菜学、农业经济管理和土地资源管理等3个二级学科国家重点学科，食品科学被列为国家重点（培育）学科，有8个学科进入江苏高校优势学科建设工程，7个学科入选国家高等学校学科创新引智基地（111计划）。
ESI
基本科学指标数据库ESI（Essential Science Indicators）世界排名前1%的学科共有7个：农业科学、植物与动物学、环境与生态学、生物与生物化学、工程学、微生物学、分子生物学与遗传学。
其中，农业科学、植物与动物学ESI世界排名前1‰.
注：基本科学指标数据库（ESI）排名前1%的学科一般被视为国际高水平学科，而进入ESI排名前1‰的学科一般被认为已经达到国际顶尖水平。
学科建设平台
世界一流学科建设学科
作物学、农业资源与环境
985工程优势学科创新平台
平台名称：高效农业与食物安全优势学科创新平台
包含重点学科领域有：作物品种创新与优质高产、农作物生物灾害控制与生物安全保障、农业废弃物资源利用与农田生态环境保护、动物健康与动物源食品质量安全控制、食物安全的政策保障与可持续管理。
“2011计划”协同创新中心
食品科学与安全协同创新中心
“111计划”引智基地名单
农业资源与环境学科生物学研究创新引智基地、肉类食品质量安全控制及营养学创新引智基地、作物生产精确管理研究创新引智基地、农村土地资源多功能利用研究学科创新引智基地、特色园艺作物育种与品质调控研究学科创新引智基地。
博硕士授予点
一级学科博士点：应用经济学、生物学、科学技术史、农业工程、食品科学与工程、作物学、园艺学、农业资源与环境、植物保护、畜牧学、兽医学、水产、农林经济管理、公共管理、草学、生态学、图书情报与档案管理。
一级学科硕士点：哲学、理论经济学、社会学、外国语言文学、数学、化学、海洋科学、机械工程、计算机科学与技术、轻工技术与工程、环境科学与工程、林学、中药学、管理科学与工程、工商管理、图书情报与档案管理、风景园林学、应用经济学、生物学、科学技术史、农业工程、食品科学与工程、作物学、园艺学、农业资源与环境、植物保护、畜牧学、兽医学、水产、农林经济管理、公共管理、草学、生态学。
博士后科研流动站
作物学、植物保护、农业资源利用、园艺学、畜牧学、兽医学、食品科学与工程、公共管理、科学技术史、生物学、水产、农业工程、动物学、生态学、草学。
重点学科
国家重点学科
一级学科国家重点学科：作物学、植物保护、农业资源利用、兽医学
二级学科国家重点学科：蔬菜学、农业经济管理、土地资源管理
国家重点（培育）学科：食品科学
省级重点学科
十二五期间一级学科省重点学科：科学技术史、畜牧学、公共管理、生态学、草学
二级学科省重点学科：植物学、微生物学、科学技术史、食品科学、果树学、植物营养学、动物营养与饲料科学、基础兽医学、临床兽医学、土地资源与管理、生物信息学、农村发展、植物检疫与生物安全、农业信息学。
江苏高校优势学科建设工程
作物学、植物保护、农业资源与环境、兽医学、食品科学与工程、农林经济管理、现代园艺科学、农业信息学。
学科评估
在教育部2012年第三轮全国高校学科评估中，南京农业大学共有4个学科排在全国前三名，8个学科排在全国前五名，12个学科排在全国前十名，其中农业资源与环境学科排名全国第一位。
在教育部2017年第四轮全国高校学科评估中，南京农业大学共有7个学科评估结果为A类，其中4个学科获评A+，分别是作物学、农业资源与环境、植物保护、农林经济管理，A+学科数并列全国高校第11位。
