5. 课题组近年代表性论文
1)     Jia Yang, Qi Yang, Menghua Cai, Chao Li, Fei Gao, Huaishan Wang, Dongdong Wang, Yi Fu, Yu Zhou, Hui Chen, Yu Hu, Xuan Zhang, Wei He*, Jianmin Zhang*. ATPase Thorase Regulates Mitochondrial Quality Control and Pathogenesis of Neurodegenerative Diseases. (Under revision on Neuron)
2)     Huaishan Wang, Fei Gao, Jia Yang, Yi Fu, Yingchao Xue, Qi Yang, Menghua Cai, Xue Zhang, Yu Zhou, Kangle Zhai, Yu Hu, Hui Chen, Fang Liu, Yi Xu, Chao Ma, Wei He* and Jianmin Zhang*. TSPO/PBR Knockout Promotes Amyloid Pathology and Neuroinflammation by Affecting Microglia Phagocytosis. (Under revision on Neurobiology of ageing)
3)    Yi Fu, Dongdong Wang, Huaishan Wang, Junwen Zhang, Hui Chen, Yu Hu, Xuan Zhang, Mingyao Ying, Wei He*, Jianmin Zhang^*. TSPO deficiency induces mitochondrial dysfunction, leading to hypoxia, angiogenesis and a growth-promoting metabolic shift towards glycolysis in glioblastoma. Neuro Oncol. 2019 Sep 29. pii: noz183. doi: 10.1093/neuonc/noz183.
4)    Yuxia Li, Xinfeng Wang, Da Teng, Hui Chen, Maoshui Wang, Junjing Wang, Jianmin Zhang^*, Wei He.Identification of the Ligands of TCRγδ by Screening the Immune Repertoire of γδT Cells from Patients with Tuberculosis. Front. Immunol., 24 September 2019 https://doi.org/10.3389/fimmu.2019.02282
5)     Menghua Cai, Yan Zhu, Zinan Li, Yu Zhou, Yu Hu, Hui Chen, Yun Liu *, Wei He * and Jianmin Zhang*. Profiling the Gene Expression and DNA Methylation in the Mouse Brain after Ischemic Preconditioning. Neuroscience. 406 (2019) 249–261
6)     Fei Gao, Jianmin Zhang *. Mitochondrial quality control and neurodegenerative diseases. Neuronal Signalling. (2018) https://doi.org/10.1042/NS20180062
7)     Yingchao Xue, Xiping Zhan, Shisheng Sun, Senthilkumar S. Karuppagounder, Shuli Xia, Valina L. Dawson, Ted M. Dawson, John Laterra, Jianmin Zhang* and Mingyao Ying*. Synthetic mRNAs drive highly efficient iPSC cell differentiation into dopaminergic neurons. Stem Cell Translational Medicine. 2018 Nov 1. doi: 10.1002/sctm.18-0036
8)     Peng Dong, Xiangwu Ju, Yiwu Yan, Siya Zhang, Menghua Cai, Huaishan Wang, Hui Chen, Yu Hu, Lianxian Cui, Jianmin Zhang*, Wei He*. γδ T cells provide protective function in highly pathogenic avian H5N1 influenza A virus infection. 2018 Dec 4;9:2812. doi: 10.3389/fimmu.2018.02812. eCollection 2018..
9)     Xue Zhang, Fei Gao, Dongdong Wang, Chao Li, Yi Fu, Wei He^*, Jianmin Zhang^*. Tau pathology in Parkinson’s disease. Front. Neurol., October 2, 2018; https://doi.org/10.3389/fneur.2018.00809
10)   Jianmin Zhang, Jia Yang, Huaishan Wang, Omar Sherbini, Matthew J. Keuss, George K. E. Umanah, Emily Ling-Lin Pai , Zhikai Chi, Kaisa M. A. Paldanius, Wei He, Hong Wang, Shaida A. Andrabi, Ted M. Dawson, and Valina L. Dawson The AAA + ATPase Thorase is neuroprotective against ischemic injury. J Cereb Blood Flow Metab. 2018 Jan 1:271678X18769770. doi: 10.1177/0271678X18769770
11)   Zinan Li, Siya Zhang, Ying Wan, Weiqing Wang, Yuli Zhu, Zhen Li, Yu Hu, Huaishan Wang, Hui Chen, Lianxian Cui, Xuan Zhang, Jianmin Zhang*, Wei He*. miR-146a Regulates the Positive Selection During T Cell Development. Front Immunol. 2018 Jan 23;8:2006. doi: 10.3389/fimmu.2017.02006
12)   Yuli Zhu, Siya Zhang, Zinan Li, Huaishan Wang, Zhen Li, Yu Hu, Hui Chen, Xuan Zhang, Lianxian Cui, Denian Ba, Jianmin Zhang*, Wei He*. MiR-125b-5p and miR-99a-5p regulate the activation and cytotoxicity of gd T cells. Cell Mol Immunol. 2018 Feb 12. doi: 10.1038/cmi.2017.164
13)   Hui Chen, Mingjin Zou, Da Teng, Yu Hu, Jianmin Zhang*, Wei He¹*. Profiling the pattern of the human T cell receptor γδ complementary determinant region 3 repertoire in patients with lung carcinoma. Cell Mol Immunol. 2018 Feb 5. doi: 10.1038/cmi.2017.157
14)   Fei Gao, Jia Yang, Chao Li, Huaishan Wang, Wei He^*, Jianmin Zhang^*. Mitophagy in Parkinson Disease: Pathogenic Roles and Therapeutic Implications. Front. Neurol., 2017; doi.org/10.3389/fneur.2017.00527
15)   Wen-Xiu Mo, Shan-Shan Yin, Hua Chen, Chen Zhou, Jia-Xin Zhou, Li-Dan Zhao, Yun-Yun Fei, Hua-Xia Yang, Jing-Bo Gou, Yu-Jia Mao, Lin-Fang Huang, Wen-Jie Zheng, Wen Zhang, Jian-Min Zhang, Wei He*, Xuan Zhang*. Chemotaxis of Vδ2 T cells to the joints contributes to the pathogenesis of Rheumatoid Arthritis. Ann Rheum Dis. 2017 Dec;76(12):2075-2084. doi: 10.1136/annrheumdis-2016-211069
16)   Chen H, Zou M, Teng D, Zhang J*, He W. Characterization of the diversity of T cell receptor γδ complementary determinant region 3 in human peripheral blood by Immune Repertoire Sequencing. J Immunol Methods. 2017 Jan 31. pii: S0022-1759(16)30291-5. doi: 10.1016/j.jim.2017.01.009.
17)   Wang H, Zhai K, Xue Y, Yang J, Yang Q, Fu Y, Hu Y, Liu F, Wang W, Cui L, Chen H, Zhang J*, He W*. Global Deletion of TSPO Does Not Affect the Viability and Gene Expression Profile. PLoS One. 2016 Dec 1;11(12):e0167307. doi: 10.1371/journal.pone.0167307
18)   Jianmin Zhang, Huaishan Wang, Omar Sherbini, Emily Ling-lin Pai, Sung-Ung Kang, Ji-Sun Kwon, Jia Yang, Wei He, Hong Wang, Stephen M. Eacker, Zhikai Chi, Xiaobo Mao, Jinchong Xu, Haisong Jiang, Shaida A. Andrabi, Ted M. Dawson, Valina L. Dawson. High Content Genome-Wide RNAi Screen Reveals CCR3 as a Key Mediator of Neuronal Cell Death. eNEURO. 2016 Oct 7. DOI: 10.1523/ENEURO.0185-16.2016
6. 课题组近5年专利
1)      γδT淋巴细胞中δ1链互补决定域3的优势序列及其TCR受体转染细胞与应用。授权公告日：2014.07.09；专利号：ZL 2011 1 0126369.3。
2)      基因修饰CDR3δ移植型γδT淋巴细胞及其抑癌用途。授权公告日：2014.08.13；专利号：ZL 2010 1 0518490.6。
3)      抗人γδTCR单克隆抗体的重组单链抗体G5-4ScFv及其编码基因与应用。专利申请日：2011.11.30；授权公告日：2017.04.12。专利号/申请号：201110139150.3。
4)      肿瘤结合特异性gdTCR基因修饰的αβT细胞及其抑癌用途。专利申请日：2015.11.26；授权公告日：2018.10.09；专利号/申请号：201510846740.1。
5)      一种检测过敏原的新型蛋白质芯片。专利申请日：2017.04.28;申请号 201710293500.2. （正在审理中）

二、曹雪涛课题组
1. 课题组简介
        课题组主要从事天然免疫识别与炎症疾病的基础研究、肿瘤等疾病的免疫治疗的应用研究。
2. 课题组负责人介绍
        曹雪涛，中国工程院院士，现任中国医学科学院院长、北京协和医学院校长、医学免疫学国家重点实验室主任。德国科学院院士、法国医学科学院院士、英国医学科学院院士、美国医学科学院院士、亚洲大洋洲免疫学联盟秘书长、中国免疫学会秘书长、中国医学工程学会理事长、中国科协生命科学联合体主席。
        主要从事天然免疫与炎症的基础研究和肿瘤免疫治疗转化应用研究。发现和鉴定了数种新型免疫细胞亚群和新型免疫分子，揭示天然免疫识别与应答调控新分子机制、提出免疫炎症消退新观点。提出肿瘤免疫逃逸的新途径，鉴定了预测肿瘤转移与患者预后的标志物分子，研制的树突状细胞疫苗临床试治晚期肿瘤患者完成了II期临床试验并获得CFDA批文开展III期临床试验。
        以通讯作者发表SCI收录论文230余篇，其中包括Nature、Cell、Science、Nature Immunology、Cancer Cell、Immunity等。论文SCI他引10000多次。获得国家发明专利16项、国家II类新药证书2个。创办《中国肿瘤生物治疗杂志》并任主编，Cellular and Molecular Immunology共同主编,J Mol Med和Cancer Immunology Research 副主编、任Cell、Annual Reviews of Immunology、Science Translational Medicine、eLife、Cell Research等杂志编委。研究成果曾获得2003年度国家自然科学奖二等奖；研究成果曾入选中国十大科技进展（2011）以及中国高等学校十大科技进展（五次，2000/2004/2009/2014/2015）。先后获得全国十大杰出青年（2000）、中国青年科学家奖、何梁何利科学与技术进步奖、谈家桢生命科学成就奖、首届树森兰娟人才基金“树兰医学奖”、2013年中国工程院光华工程科技奖、2016年中国科学院陈嘉庚科学奖等。培养的博士生有12名获得全国百篇优秀博士学位论文，获2014年首届中国研究生教育特等奖、2015年《Nature》导师成就奖。
3. 课题组成员介绍
组内人员：
姜明红 博士 副研究员，硕士生导师 jiangminghong@163.com    69156966
王春梅 博士 副研究员，硕士生导师 wangcm1977@126.com   69156966
许小青 博士 助理研究员 xxqdata@163.com    65281907
王冰晶 博士助理研究员   winter_wbj@hotmail.com   69156966
刘音   主管技师  liuyinbj@sina.com  69156966
4. 课题组主要科研项目

5. 课题组近5年代表性论文
1.  Shuo Liu, Minghong Jiang, Wendie Wang, Wei Liu, Xiaoqi Song, Zhongfei Ma, Shikun Zhang, Lun Liu, Yin Liu, Xuetao Cao. Nuclear RNF2 inhibits interferon function by promoting K33-linkage of STAT1 disassociation from DNA. Nat Immunol.2018 Jan;19:41-52.
2.  Zheng Q, Hou J, Zhou Y, Li Z, Cao X. The RNA helicase DDX46 inhibits innate immunity by entrapping m6A-demethylated antiviral transcripts in the nucleus. Nat Immunol. 2017 Oct;18(10):1094-1103.
3.  Xia M, Liu J, Liu S, Chen K, Lin H, Jiang M, Xu X, Xue Y, Liu W, Gu Y, Zhang X, Li Z, Yi L, Qian Y, Zhou C, Li R, Zhang X, Li Z, Cao X. Ash1l and lnc-Smad3 coordinate Smad3 locus accessibility to modulate iTreg polarization and T cell autoimmunity. Nature communications, 2017 Jun 9;8:15818. 
4.  Chunmei Wang, Qinlan Wang, Xiaoqing Xu, Bin Xie, Yong Zhao, Nan Li, XuetaoCao.The methyltransferase NSD3 promotes antiviral innate immunity via direct lysine methylation of IRF3. J EXP MED. 2017. Vol. 214 No. 12 3597–3610
5.  Jia Xu, Xiaoqing Xu, Bingjing Wang, Yuanwu Ma, Lianfeng Zhang, Henan Xu, Ye Hu, Jiacheng Wu, and Xuetao Cao. Nuclear carbonic anhydrase 6B associates with PRMT5 to epigenetically promote IL-12 expression in innate response. PNAS, 2017,114(32):8620-8625.
6.  Chunyuan Zhao,  MutianJia, Hui Song, Zhongxia Yu, Wenwen Wang, Qi Li, Lining Zhang, Wei Zhao,  Xuetao Cao. The E3 ubiquitin ligase TRIM40 attenuates antiviral immune responses by targetingMDA5 and RIG-I.Cell report.2017. 21.6.1613-1623
7.  Li X, Zhang Q, Shi Q, Liu Y, Zhao K, Shen Q, Shi Y, Liu X, Wang C, Li N, Ma Y, Cao X. Demethylase Kdm6a epigenetically promotes IL-6 and IFN-β production in macrophages. Journal of Autoimmunity. 2017,Jun;80:85-94.
8.  Wendie Wang, Minghong Jiang, Shuo Liu, Shikun Zhang, Wei Liu, Yuanwu Ma, Lianfeng Zhang, Jiyan Zhang, and Xuetao Cao. RNF122 suppresses antiviral type I interferon production by targeting RIG-I CARDs to mediate RIG-I degradation.  PNAS, 2016, Aug. 113 (34)9581–9586
9.  Qian Zhang, Kai Zhao, Qicong Shen, Yanmei Han, Yan Gu, Xia Li, Dezhi Zhao, Yiqi Liu, ChunmeiWang,Xiang Zhang, Xiaoping Su, Juan Liu, Wei Ge, Ross L. Levine, Nan Li &Xuetao Cao.  Tet2 is required to resolve inflammation by recruiting Hdac2 to specifically repress IL-6 Nature2015 Sep 17;525(7569):389-93
10.  Mingjin Yang, Taoyong Chen, Xuelian Li, Zhou Yu, Songqing Tang, Chen Wang, Yan Gu, Yanfang Liu, Sheng Xu, Weihua Li, Xuemin Zhang, Jianli Wang&Xuetao Cao.  K33-linked polyubiquitination of Zap70 by Nrdp1 controls  CD8+ T cell activationNature immunology 2015 Dec.16(12) 1253-1264
6. 课题组近5年专利

三、黄波课题组
1. 课题组简介
        实验室主要研究肿瘤免疫，肿瘤生物治疗，生物机械力，肿瘤休眠，肿瘤代谢等前沿医学科学问题。在Cancer cell、Nature Materials、Nature Cell Biology、Nature Communications、Journal of Clinical Investigation、Blood、Cell Research、Leukemia、EMBO Reports、Cancer Immunology Research、Cancer Research、Oncogene、Biomaterials、Journal of Immunology等一系列主流杂志上发表50多篇研究论文，被SCI引用3000多次。实验室目前有副教授/副研究员1名，在站博士后2名，博士研究生10名，硕士研究生3名。
        研究方向：
（1）肿瘤休眠：探讨化学因素（IFN-gamma/IFN-beta等）和物理因素（生物机械力）诱导肿瘤休眠机制，探寻打破肿瘤休眠、诱导肿瘤休眠细胞进入凋亡的治疗方法；
（2）肿瘤代谢：分析肿瘤细胞、肿瘤干细胞、肿瘤相关免疫细胞的特殊代谢方式，发现以代谢为基础的肿瘤治疗靶点；
（3）肿瘤生物治疗：以肿瘤细胞来源的微颗粒为载体，携带化疗药物、溶瘤病毒等对肿瘤进行治疗；对微颗粒的化疗增敏效应或者作为新型口服疫苗进行研究；微颗粒治疗胆管癌及恶性肿瘤患者胸腹水的临床前机制研究；
（4）肿瘤生物机械力：运用生物力学筛选肿瘤干细胞，对肿瘤发生发展进行研究以及探寻肿瘤治疗新思路新靶点；探究生物力学信号对细胞增殖、分化的影响，揭示生物力学信号在T细胞对肿瘤干细胞杀伤过程中的作用；
（5）干细胞体外培养及扩增：利用3D纤维蛋白软胶体外扩增造血干细胞，为临床免疫治疗寻找新的途径及方法。
 
2. 课题组负责人介绍
        黄波，协和学者特聘教授、博士生导师，国家杰出青年基金，获国家百千万人才，国家有突出贡献的中青年专家称号，科技部中青年科技创新领军人才，入选国家万人计划。
        现任中国医学科学院基础医学研究所副所长、免疫学系常务副主任，并兼任中国免疫学会副秘书长与常务理事、中国医学科学院青年创新联盟理事长、国际免疫学会联盟（IUIS）教育委员会委员、中国免疫学会肿瘤免疫与肿瘤生物治疗专业委员会主任委员、中国生物化学与分子生物学学会理事、中国抗癌协会肿瘤生物治疗专业委员会秘书长，担任European Journal of Immunology 、Cellular and Molecular Immunology、Cancer Letters、Immunology Letters杂志编委。
        主要研究集中在肿瘤免疫生物学、肿瘤免疫和生物治疗，完全自主研究的低剂量环磷酰胺治疗尖锐湿疣和肿瘤囊泡治疗肿瘤技术分别已用于临床以及进入临床试验阶段。
 
3. 课题组成员介绍
刘玉英，副研究员，博士，13161773902@163.com, 69156450
付佳霖，助理研究员，博士，fjl1988@126.com, 69156464
解静，博士后，xhxiejing@163.com, 69156450
Roland Fiskesund, 博士后，rolandfiskisund@ki.se, 69156464
 
4. 课题组主要科研项目
（1）国自然科学中心项目，天然免疫细胞活化和死亡机制及其炎性疾病， 2018-2023，子课题负责人：黄波；
（2）国自然国际合作与交流项目，基于多角度筛选及联合生物标志的黑色素瘤及肺癌新免疫疗法， 2016-2019，项目负责人：黄波；
（3）国自然重点项目，肿瘤微颗粒介导M2型肿瘤相关巨噬细胞（TAM）生成的机制与基于微颗粒靶向TAM的治疗基础研究， 2016-2020，项目负责人：黄波；
（4）国自然面上项目，肿瘤细胞来源的微颗粒介导卵巢癌的免疫治疗与化疗， 2015-2018，项目负责人：黄波；
（5）国家杰出青年科学基金，肿瘤免疫，2013-2016，项目负责人：黄波；
（6）973课题，逆转免疫抑制和打破免疫耐受，重激活抗肿瘤应答的肿瘤免疫治疗新途径的研究，2014-2019，子课题负责人：黄波；
（7）中国医学科学院医学健康与科技创新工程项目，免疫治疗及新型生物治疗， 2016-2020，项目首席：黄波；
（8）国自然面上项目，IFN-β激活IDO1-Kyn-AhR信号通路调节肿瘤再生细胞休眠， 2018-2021，项目负责人：刘玉英
 
5. 课题组近5年代表性论文
(1) Liu Y, Liang X, Dong W, Lv J, Fiskesund R, Xie J, Jin X, Degao Chen, Mo S, Zhang T, Cheng F, Zhou Y, Zhang H, Wang J, Hu Z, Cao X, Qin F, Huang B*. Tumor-repopulating cells transfer kynurenine to upregulate PD-1 expression in tumor-specific CD8+ T cells through AhR activation. Cancer Cell.Accepted.
(2) Liu Y, Lv J, Liu J, Liang X, Jin X, Xie J, Chen D, Fiskesund R, Dong W, Mo S, Zhang T, Cheng F, Zhou Y, Zhang H, Hu Z, Cao X, Qin F, Huang B*. J Clin Invest. Accepted.
(3)Ma R, Ji T, Zhang H, Dong W, Chen X, Xu P, Chen D, Ma J, Tang K, Zhang Y, Peng Y, Lu J, Zhang Y, Qin X, Cao X, Wan Y, Huang B*. A Pck1-directed glycogen 1 metabolic program regulates formation and maintenance of memory CD8+ T cells.Nat Cell Biol. 2018; 20:21-27.
(4) Liu Y, Liang X, Yin X, Lv J, Tang K, Ma J, Ji T, Zhang H, Dong W, Jin J, Chen D, Li Y, Zhang S, Xie H, Zhao B, Zhao T, Lu J, Hu Z, Cao X, Qin X, Huang Bo*. Blockade of IDO-kynurenine-AhR metabolic circuitry abrogates IFN-γ-induced immunologic dormancy of tumor-repopulating cells. Nat Commun. 2017; 8:15207.
(5) Luo S, Li Y, Ma R, Liu J, Xu P, Zhang H, Tang K, Ma J, Liu N, Zhang Y, Sun Y, Ji T, Liang X, Yin X, Liu Y, Tong W, Niu Y, Wang N, Wang X,Huang Bo*. Downregulation of PCK2 remodels tricarboxylic acid cycle in tumor-repopulating cells of melanoma. Oncogene.2017; 36:3609-3617.
(6) Sun Y, Zheng Z, Zhang H, Yu Y, Ma J, Tang K, Xu P, Ji T, Liang X, Chen D, Jin X, Zhang T, Long Z, Liu Y, Huang Bo*. Chemotherapeutic tumor microparticles combining low dose irradiation reprogram tumor-promoting macrophages through a tumor-repopulating cell-curtailing pathway. Oncoimmunology. 2017; 6(6):e1309487.
(7) Dong W, Zhang H, Yin X, Liu Y, Chen D, Liang X, Jin X, Lv J, Ma J, Tang K, Hu Z, Qin X, Huang Bo*. Oral delivery of tumor microparticle vaccines activates NOD2 signaling pathway in ileac epithelium rendering potent antitumor T cell immunity. OncoImmunology. 2017; 6(3):e1282589.
(8) Jin X, Ma J, Liang X, Tang K, Liu Y, Yin X, Zhang Y, Zhang H, Xu P, Chen D, Zhang T, Lu J, Hu Z, Qin X, Zeng X, Li L, Huang Bo*. Pre-instillation of tumor microparticles enhances intravesical chemotherapy of nonmuscle-invasive bladder cancer through a lysosomal pathway. Biomaterials. 2017; 113:93-104.
(9) Ma J, Zhang Y, Tang K, Zhang H, Yin X, Li Y, Xu P, Sun Y, Ma R, Ji T, Chen J, Zhang S, Zhang T, Luo S, Jin Y, Luo X, Li C, Gong H, Long Z, Lu J, Hu Z, Cao X, Wang N, Yang X, Huang B*. Reversing drug resistance of soft tumor-repopulating cells by tumor cell-derived chemotherapeutic microparticles. Cell Res. 2016;26:713-27.
(10) Ran L, Tan X, Li Y, Zhang H, Ma R, Ji T, Dong W, Tong T, Liu Y, Chen D, Yin X, Liang X, Tang K, Ma J, Zhang Y, Cao X, Hu Z, Qin X, Huang Bo* . Delivery of oncolytic adenovirus into the nucleus of tumorigenic cells by tumor microparticles for virotherapy. Biomaterials. 2016; 89:56-66.
(11) Ma R, Ji T, Chen D, Dong W, Zhang H, Yin X, Ma J, Liang X, Zhang Y, Shen G, Qin X, Huang Bo*. Tumor cell-derived microparticles polarize M2 tumor-associated macrophages for tumor progression. Oncoimmunology. 2016; 5(4):e1118599.
(12) Tang K, Hu L, Ma J, Zhang H, Zhang Y, Li Y, Ma R, Luo S, Liu D, Long G, Han M, Liu S, Song A, Shen M, Hu G, Huang Bo*. Brief Report: Human Mesenchymal Stem-Like Cells Facilitate Floating Tumorigenic Cell Growth via Glutamine-Ammonium Cycle. Stem Cells.2015; 33:2877-84.
(13) Wang Z, Cheng Q, Tang K, Sun Y, Zhang K, Zhang Y, Luo S, Zhang H, Ye D, Huang Bo*. Lipid mediator lipoxin A4 inhibits tumor growth by targeting IL-10-producing regulatory B (Breg) cells. Cancer Lett.2015; 364:118-24.
(14) Zhang H & Huang Bo*. Tumor cell-derived microparticles: a new form of cancer vaccine. Oncoimmunology. 2015; 4:e1017704.
(15) Li Y, Luo S, Ma R, Liu J, Xu P, Zhang H, Tang K, Ma J, Zhang Y, Liang X, Sun Y, Ji T, Wang N, Huang Bo*. Upregulation of cytosolic phosphoenolpyruvate carboxykinase is a critical metabolic event in melanoma cells that repopulate tumors. Cancer Res. 2015; 75:1191-6.
(16) Zhang H, Tang K, Zhang Y, Ma R, Ma J, Li Y, Luo S, Liang X, Ji T, Gu Z, Lu J, He W, Cao X, Wan Y, Huang Bo*. Cell-free tumor microparticle vaccines stimulate dendritic cells via cGAS/STING signaling. Cancer Immunol Res. 2015; 3:196-205.
(17) Ma R, Zhang W, Tang K, Zhang H, Zhang Y, Li D, Li Y, Xu P, Luo S, Cai W, Ji T, Katirai F, Ye D, Huang Bo*. Switch of glycolysis to gluconeogenesis by dexamethasone for treatment of hepatocarcinoma. Nat Commun. 2013; 4:2508.
(18) Liu J, Tan Y, Zhang H, Zhang Y, Xu P, Chen J, Poh YC, Tang K, Wang N, Huang Bo*. Soft fibrin gels promote selection and growth of tumorigenic cells. Nat Mater. 2012; 11:734-41.
(19) Tang K, Zhang Y, Zhang H, Xu P, Liu J, Ma J, Lv M, Li D, Katirai F, Shen GX, Zhang G, Feng ZH, Ye D, Huang Bo*. Delivery of chemotherapeutic drugs in tumour cell-derived microparticles. Nat Commun. 2012; 3:1282.
(20) Lv M, Zhang X, Jia H, Li D, Zhang B, Zhang H, Hong M, Jiang T, Jiang Q, Lu J, Huang X, Huang Bo*. An oncogenic role of miR-142-3p in human T cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) by targeting glucocorticoid receptor alpha and cAMP/PKA pathways. Leukemia.2012; 26:769-777.
 
6. 课题组近5年专利
        一种肿瘤化疗药物制剂及其制备方法，ZL201110241369.8，专利权人：黄波；湖北盛齐安生物科技有限公司
 
四、罗云萍课题组
1. 课题组简介
        本课题组研究方向集中在肿瘤微环境中的免疫细胞与肿瘤细胞的相互作用以及与肿瘤发生，浸润和转移的关系。研究肿瘤干细胞与肿瘤微环境的相互关系，筛选实体肿瘤干细胞中潜在、特异性的生物分子标志，深人分析与研究这些分子标志以及它们的生物学功能，探寻其作为肿瘤治疗靶点的潜力。
 
2. 课题组负责人介绍
        罗云萍，高级职称，博士，yunpingluo@126.com 电话：010-69156475
        罗云萍教授是基础所特聘教授，长期致力于肿瘤微环境与肿瘤干细胞的研究工作，课题组主要围绕肿瘤微环境中大量存在的肿瘤相关巨噬细胞，从转录组、代谢组和表观调控等角度分别深入研究肿瘤相关巨噬细胞的功能重塑机制及其在促进肿瘤生长和转移中作用。研究结果在Journal of Clinical Investigation，Cancer Research, Oncogene, Stem Cells, PNAS等高水平的杂志上发表。
 
3. 课题组成员介绍
        陈翀，中级职称，博士，chenchongxyp86@163.com 电话：010-65284024
        段昭君，中级职称，博士，jun-0512@163.com 电话：010-65284024
 
4. 课题组主要科研项目
(1) 国家自然科学基金面上项目，81672914，肿瘤相关巨噬细胞分泌Exosome包裹的microRNA对肿瘤细胞干性特性的调控机制的研究，起始时间：2017/01-2020/12，资助金额：60万元，在研中，主持。
(2) 国家自然科学基金面上项目，81472654，分泌型microRNA调控巨噬细胞表型机制及其作为诊断标记物可行性探索，起始时间：2015/01-2018/12，资助金额：72万元，在研中，主持。
(3) 科技部重大科学研究计划，2013CB967200，肿瘤干细胞在实体肿瘤发展中的调控机制研究，起始时间：2013/01-2017/12，资助金额：568万元，在研中，课题主持。
(4) 国家自然科学基金重大研究计划，91029734，非可控性炎性微环境对肿瘤干细胞转录网络机制的调控及其新的治疗策略的探索，起始时间：2011/01-2013/12，资助金额：50万元，已结题，主持。
(5) 国家自然科学基金面上项目，81071711，“再教育”肿瘤相关巨噬细胞重建肿瘤免疫微环境-基于靶向调节Fra-1信号转导通路的免疫治疗，起始时间：2011/01-2013/12，资助金额：32万元，已结题，主持。
 
5. 课题组近5年代表性论文
(1) Chen C, Cao F, Bai L, 2, Liu Y, 2, Xie J, Wang W, Si Q, Yang J, Chang A, Liu D, Liu D, Chuang TH, Xiang R and Luo Y*, IKKβ enforces a LIN28B/TCF7L2 positive feedback loop that promotes cancer cell stemness and metastasis, Cancer Res, 2015, 75(8): 1725-1735
(2) Yang J, Zhang Z, Chen C, Liu Y, Si Q, Chuang TH, Li N, Gomez-Cabrerom A, Reisfeld RA, Xiang R*, Luo Y*, MicroRNA-19a-3p inhibits breast cancer progression and metastasis by inducing macrophage polarization through downregulated expression of Fra-1 proto-oncogene. Oncogene, 2014, 33(23): 3014-3023
(3) Yang J, Liao D, Chen C, Liu Y, Chuang TH, Xiang R, Markowitzb D, Reisfeld RA, Luo Y*, Tumor associated macrophages regulate murine breast cancer stem cells through a novel paracrine EGFR/Stat3/Sox-2 signaling pathway, Stem cells, 2013, 31(2): 248-258
 
6. 课题组近5年专利
(1) mir-100 抑制剂在降低癌症转移中的作用 Patent No. of China 201610601327.3 （中国发明专利）
 
五、葛微课题组
1. 课题组简介
        葛微课题组构建了完善的蛋白质组学平台，在蛋白水平上探究疾病发病过程中的蛋白表达谱变化。课题组主要研究兴趣和方向：（1）结直肠癌的免疫应答分子机制的研究；（2）基于人脑组织库的蛋白质组学研究。获得了国家自然科学基金、诺和诺德、医科院创新工程等项目的资助。2015-2017年，发表SCI论文32篇。目前课题组共培养5名博士生，3名硕士生，获“北京市优秀毕业生”称号1次，国家奖学金3次。
 
2. 课题组负责人介绍
        葛微教授本科毕业于北京师范大学化学系，之后在河北农业大学从事教学科研工作5年。2002年，获得牛津大学全额奖学金资助攻读有机化学博士，师从Professor Sir Jack. E. Baldwin，2005年在牛津大学取得博士学位，2005-2012年在牛津大学Professor Christopher J Schofield课题组做博士后研究。2013年回国后被聘为中国医学科学院基础医学研究所免疫系教授，博士生导师，获得协和学者称号。
 
3. 课题组成员介绍
王霞，助理研究员，博士，邮箱：wangxia1507@gmail.com，电话：15117924226
方虓，实验室管理员，邮箱：fangxkey@126.com，电话：13051168676
熊  峰  博士后
高延盼  博士生
占少华  博士生
罗  丹  博士生
张雨生  博士生
陈彦宇  硕士生
夏文超  硕士生
 
4. 课题组主要科研项目
（1）国家自然科学基金：DNA 甲基化调控的转录因子HSF4 在DC 细胞天然免疫应答中的调控机制研究 。
（2）诺和诺德中国医学科学院联合基金：测试对FTO的抑制是否能够调节ghrelin（生长素）的表达和是否对治疗糖尿病有用。
（3）中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目：炎症与重大疾病的基础与干预研究。
（4）中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目：神经科学与重大神经退行性疾病防治研究
（5）中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目：灵长类动物平台
（6）中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目：五种自身免疫性疾病发病机制的研究
 
5. 课题组近5年代表性论文
（1）      Xu B, Zhao Y, Wang X, Gong P, Wei G. MZH29 is a novel potent inhibitor that overcomes drug resistance-FLT3 mutations in acute myeloid leukemia. Leukemia 2017 Apr, 31: 913-921.
（2）      Benhong Xu, Yanpan Gao, Shaohua Zhan, Feng Xiong, WenyingQiu, Xiaojing Qian, Tao Wang, Naili Wang, Di Zhang, Qian Yang, Renzhi Wang, XinjieBao, Wanchen Dou, Rui Tian, Shu Meng, WeipingGai, Yue Huang, Xiaoxin Yan, Wei Ge*, Chao Ma*. Quantitative protein profiling of hippocampus during human aging. Neurobiol Aging 2016 Mar, 39:46-56.
（3）      YanpanGao, Wei Ge*. Histone methyltransferase DOT1L inhibits osteoclastogenesis and protects against osteoporosis. Cell Death & Disease. 2017.
（4）      Shaohua Zhan, Tianxiao Wang, Wei Ge. Multiple functions of the E3 ubiquitin ligase CHIP in immunity. International Reviews of Immunology  2017 Jun 2:1-13.
（5）      Qingzhong He, Wei Ge. The tandem Agenet domain of fragile X mental retardation protein interacts with FUS. Scientific Reports, 2017 Apr, 7, 962.
（6）      Yanyu Chen, Yong Xie, Lai Xu, Shaohua Zhan, Yi Xiao, Yanpan Gao, Bin Wu, Wei Ge. Protein content and functional characteristics of serum-purified exosomes from patients with colorectal cancer revealed by quantitative proteomics. International Journal of Cancer. 2017 Feb 15;140(4):900-913
（7）      FuxingZuo, Feng Xiong, Xia Wang, Xueyuan Li, Renzhi Wang, Wei Ge, XinjieBao. Intrastriatal transplantation of human neural stem cells restores the impaired subventricular zone in Parkinsonian mice. Stem Cells. 2017 Jun;35(6):1519-1531.
（8）      YanpanGao, Yanyu Chen, Shaohua Zhan, Wenhao Zhang, Feng Xiong and Wei Ge. Comprehensive proteome analysis of lysosomes reveals the diverse function of macrophages in immune responses. Oncotarget, 2017 Jan, Vol. 8, (No. 5), pp: 7420-7440.
（9）      Lai Xu, Yanpan Gao, Yanyu Chen, Yi Xiao, Qingzhong He, HuizhongQiu, Wei Ge*. Quantitative proteomics reveals that distant recurrence-associated protein R-Ras and Transgelin predict post-surgical survival in patients with Stage III colorectal cancer. Oncotarget 2016 May, 7, 43868-43893.
（10）      Wei Ge, Dongxu Li, YanpanGao, Xuetao Cao. The Roles of Lysosomes in Inflammation and Autoimmune Diseases. Int Rev Immunol2015 Sep, 34(5):415-431.
 
6. 课题组近5年专利
        新型双功能抗体偶联物及其制法和用途，发明人：葛微，王有朝，何庆仲，丁航海。
 
六、程根宏课题组
1. 课题组简介
        程根宏课题组以人体免疫功能在疾病发生和健康维护中的作用为突破口，从发现与疾病相关的核酸序列遗传信息出发，建立多种实验模型研究其对免疫功能和炎症反应的影响，免疫功能和炎症反应异常与疾病发生、发展的相互关系；深入挖掘所编码蛋白分子间相互作用的三维结构信息，对疾病进行预测、诊断、治疗和预防；实现从基础研究成果向临床诊断、治疗应用的快速转化。
        课题组建立以系统免疫、生物信息、结构功能及检测治疗为核心的四大平台和系统医学基础研究为支撑的体系，建立针对感染性疾病、恶性肿瘤、炎症与自身免疫疾病、代谢性疾病、老年退行性疾病的系统医学临床研究部。利用高通量组学技术获取不同疾病个体各项功能组学数据，通过生物信息学和计算生物学方法对海量数据进行整合分析，探索疾病发生、发展机制，阐明诱导疾病发生的环境因素和遗传因子，寻找预测个体对疾病及药物易感性的新途径，建立对复杂疾病更为有效的预测、诊断和治疗的个性化方案。
 
2. 课题组负责人介绍
        程根宏教授，理学博士，现任中国医学科学院基础医学研究所系统医学研究中心主任。程根宏教授1984年毕业于武汉大学获学士学位，1990年在美国纽约Albert Einstein医学院分子生物学专业获得博士学位，后曾分别在美国洛克菲洛大学和麻省理工学院做博士后研究，导师为诺贝尔奖获得者David Baltimore。从1996年开始至今，在美国洛杉矶加州大学的微生物学和分子遗传学系从事感染、免疫、癌症和代谢等多学科的研究。美国加州大学洛杉矶分校（UCLA）微生物与免疫遗传学系正教授，中科院生物物理所兼职教授,第二军医大学讲座教授，吉林大学访问教授。
        2006年获中科院百人计划奖，2008年获国家海外杰出青年奖。曾先后获得包括美国白血病与淋巴癌学会颁发的斯托尔曼奖等多项科学成就奖，2012年被选为美国科学促进会(AAAS)会士。荣获并领导美国国立卫生研究院（NIH）等多个研究机构的20多项研究基金，在国际著名杂志发表论文140篇，其中大篇分别发表在学术地位最高级的《Nature》和《Science》等杂志。历任美国卫生院科研基金评审委员和国际著名的30种杂志的评审。
 
3. 课题组成员介绍
都培双：课题组特聘教授；学历：博士； Email：psdu@ibp.ac.cn；电话：010-65105157
鲁 宁：课题组特聘教授；学历：博士；Email：ningscience@yahoo.com；电话：010-65105157
郭 蓉：课题组科研助理；学历：硕士；Email：guorong329@126.com；电话：010-65105157
 
4. 课题组主要科研项目
1)      程根宏引进人才特别资助经费项目：2013年1 月至  2014年12月；
2)      卫生行业专项项目（健康人群与重大疾病状态免疫功能数据库建立及其在疾病早期诊断和治疗评估中的应用）：2013年6月至2016年6月；
3)      中国医学科学院中央级公益性科研院所基本科研业务费项目（重大疾病的系统生物学研究）：2014年10月至2015年12月；
4)      国家科技重大专项（抗埃博拉病毒应急药物的研发）：2015年1月至2018年12月；
5)      程根宏引进人才特别资助经费项目：2015年1月至2016年12月；
6)      中国医学科学院中央级公益性科研院所基本科研业务费项目（重大免疫相关性疾病的系统生物学研究）：2016年11月至2017年11月；
7)      中国医学科学院创新工程项目。
 
5. 课题组近5年代表性论文
1)      Lulan Wang, Stephanie G. Valderramos, Aiping Wu, Songying Ouyang, Chunfeng Li, Patricia Brasil, Myrna Bonaldo, Thomas Coates, Karin Nielsen-Saines, Taijiao Jiang,  RoghiyhAliyari, and Genhong Cheng. From Mosquitos to Humans: Genetic Evolution of Zika Virus. Cell Host Microbe 19:561-565. Volume 19, Issue 5, 11 May 2016, Pages 561–565.
2)      Z.Wang, J.Ji,D.Peng, F.Ma, G.Cheng, and F.X.Qin.  Complex Regulation Pattern of IRF3 Activation Revealed by a Novel Dimerization Reporter System.  J Immunol. 2016 May 15;196(10):4322-30.
3)      Shanshan Wang, Yongzhi  Chen, Chunfeng  Li, Yaoxing  Wu, Lei  Guo, Changwei  Peng, Yueping Huang, Genhong  Cheng and F. Xiao-Feng Qin. TRIM14 inhibits hepatitis C virus infection by SPRY domain-dependent targeted degradation of the viral NS5A protein. Scientific Reports. Sci Rep. 2016; 6: 32336.
4)      Lidong Wang , Xinxin Ci , HongmingLv, Xiaosong Wang, F Xiaofeng Qin and Genhong Cheng. Isotetrandrine ameliorates tert-butyl hydroperoxide-induced oxidative stress through upregulation of heme oxygenase-1 expression. Experimental Biology and Medicine. May 2, 2016.
5)      Lulan Wang, Aiping Wu, Yao E. Wang, Natalie Quanquin, Chunfeng Li, JingfengWang,Hsiang-Wen Chen, Suyang Liu, Ping Liu, Hong Zhang,F. Xiao-Feng Qin, TaijiaoJiang,Genhong Cheng. Functional Genomics Reveals Linkers Critical for Influenza Virus Polymerase. Journal of Virology. J Virol ，March 2016， 90:2938-47.
6)      Chang, S., Sun, D., Liang, H., Wang, J., Li, J., Guo, L., Wang, X., Guan, C., Boruah, B.M., Yuan, L., ,G. Cheng,W. Wang, and Y.F. Liu. Cryo-EM structure of influenza virus RNA polymerase complex at 4.3 A resolution. Mol Cell.2015
7)      Deng, L., M. Liu, S. Hua, Y. Peng, A. Wu, F. X. Qin, G. Cheng, and T. Jiang.  Network of co-mutations in Ebola virus genome predicts the disease lethality. Cell Res 2015,25:753-756.
8)      Wang, L., A. Wu, Y. E. Wang, N. Quanquin, C. Li, J. Wang, H. W. Chen, S. Liu, P. Liu, H. Zhang, F. X. Qin, T. Jiang, and G. Cheng.  Functional Genomics Reveals Linkers Critical for Influenza Virus Polymerase. J Virol 2015,90:2938-2947.
9)      Qin, F. X., C. Y. Jiang, T. Jiang, and G. Cheng.  New targets for controlling Ebola virus disease. Natl Sci Rev 2015,2:266-267.
10)      Li, C., Wu, A., Peng, Y., Wang, J., Guo, Y., Chen, Z., Zhang, H., Wang, Y., Dong, J., Wang, F. X. Qin, G. Cheng, T.Deng and T. Jiang. Integrating computational modeling andfunctional assays to decipher thestructure-function relationship ofinfluenza virus PB1 protein. Sci Rep 2014,4, 7192.
11)      L. Zhao, T. Hua, C. Crowley, H. Ru, X. Ni, N. Shaw, L. Jiao, W. Ding, L. Qu, L. W. Hung, W. Huang, L. Liu, K. Ye, S. Ouyang, G. Cheng and Z. J. Liu. Structural analysis of asparaginyl endopeptidase reveals the activation mechanism and a reversible intermediate maturation stage. Cell Res. 2014,24:344-58
 
6. 课题组近5年专利
1)      专利名称：包含25-羟基胆固醇的制剂及其制备方法和抗病毒的应用；申请号：201410441317.9
2)      专利名称：一种用于筛选流感病毒聚合酶组装抑制剂的细胞系及其构建方法 ；申请号：201511008822.5
3)      专利名称：CECAM1蛋白作为血清标记物在诊断肝脏疾病中的用途；申请号：201610292633.3
4)      专利名称：包含AFP、GP73、CEACAM1的血清标记物在诊断肝脏疾病中的用途；申请号：201610292960.9
5)      专利名称：GP73蛋白作为血清标记物在诊断癌症中的用途；申请号：201610292620.6
 

本一级学科中，全国具有“博士授权”的高校共 43 所，本次参评38 所;部分具有“硕士授权”的高校 也参加了评估;参评高校共计 78 所(注:评估结果相同的高校排序不分先后，按学校代码排列)。